1988年,回台湾募集款项360问答重新标点校正《菩提道次第广论》,为法尊法师译广论以来首次新版,共发标激征出行三仟册,之后应广化法师邀请,受聘为南普陀佛学院副院长兼教务长,正式开讲广论。1989年,发厂法制兴括洲析行1~50卷广论录音带,华藏讲堂正式成立“广论研讨班”,1990年,1~160卷发行圆满。1992年创办福智团体,并成立比丘、比丘尼僧团。1993年讲授《法华经》、《南山律在家备览》、《了凡四训》、《俞净意公遇灶神记》、《阿底峡尊者传》等,并成立财团格军封病法人福智寺。九月,接受娘盟校心圣尼师供养,率男众僧团进驻新竹凤山寺随建立佛学院,由其师长亲授予正法林佛学院名称。掉损关验2000年凤山寺首次传授三坛大戒。2001年首次吧指这殖待笔巴为在家居士传授五戒,七月与根本上师莅临福智教育园区动工洒净。2002年二月,兴办祈愿法会,由第一百世‘甘丹墀巴’仁波切主法。2004年,于春节朝礼法会后,搬到园区安养,开始宣讲《南山律在家备览》。
日常法师于2004年10月15日13时15分,在中国福建省厦门市观安详圆寂,僧腊39。荼毗香声生台观算今茶后,骨相鲜白,并有为数甚多之各种颜色的舍利花和舍利子,由其弟子迎回台湾。2006年其舍利塔于中国大陆建构完成后运抵台湾,然后供奉于云林古坑的大悲精舍。