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甲硝唑氯化钠注射液一般用于治疗厌氧菌感染，也用于治疗严重的滴虫感染，所以常用来治疗盆腔炎以及特殊类型的阴道炎。盆腔炎是女性常见病，表现为下腹痛，有时有发热，查体附件区增厚、压痛，是盆腔炎的特异体征。
对于盆腔炎，首选抗生素抗感染治疗，选择头孢类抗生素头孢曲松、头孢克洛或者喹诺酮类抗生素拜复乐、利复星或者阿奇霉素，联合甲硝唑治疗，既抗厌氧菌，也抗需氧菌。甲硝唑氯化钠注射液有时也用于治疗严重的细菌性阴道病或者滴虫性阴道炎，当然对于这两种阴道炎，一般选择口服甲硝唑治疗以及外用甲硝唑栓治疗，只有严重情况下才选择静脉用药。
