一、顺序不同:
原序列:AATTCCGG,
则反向序列为:GGCCTTAA就是原序列反过来;
互补序列:TTAAGGCC就是与原序列互补;
反向互补:CCGG球AATT就是与反向序列互补。
二、概念不同:
互补的概念就是A-T,C-良屋-G配对
要将核苷酸序列转换成反向互补序列,需要用DNASTAR软件,其中有EditSeq组件。
三、序列编码不同:
在用DNAMAN的多序列比对时,包括编码链和非编码连的比对,测序得到的目的片段可能是非计转孔谈衣行居编码链(即目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序列都是编码链松杀出考盟啊查的序列。
#!usr/bin/perl/-w
比及容级print"put传款液仍这毫in";
$a=;
chomp($a);
@q=split(//,$a);
@p=reverse@q;
foreachmy$i(@p){
if($ieq"A"){print"T";}
elsif($ieq"T"){print"A";}
elsif($ieq"G"){print"C";}
elsif($ieq"C"){print"G";}
}
扩展资料:
利用反向PCR可对未知序列扩增后进行号语阶固分析,探索邻接已知DNA片段的序列,并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆,建立全长的DNA探针。适用于基因游走、转位因子和已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。
用传统的缓冲液和其他提供者推荐的条件裂解DNA。反向PCR所扩增的片段的大小由PCR扩增片段的大呀夫欢小决定,PCR扩增的实际上限为3-4kb。
能裂解核心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游或上游区,而不裂解核心区的酶则使两上边侧序列都扩增,并带有由内切酶和环化类型决定的接点(例如,互补突头连接与钝头连接)。
参考资料来源: