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中国科学院上海免疫与感染研究所原名中国科学院上海巴斯德研究所，是中国科学院直属事业单位。
中国科学院上海巴斯德研究所成立于2004年，2023年7月正式更替为中国科学院上海免疫与感染研究所。
截至2023年12月，中国科学院上海免疫与感染研究所共有在职职工141人，在站博士后21人。其中正高级专业技术岗位28人，副高级专业技术岗位20人；截至2023年6月，中国科学院上海免疫与感染研究所设有1个中国科学院重点实验室、2个学术单元、29个研究组；设有一级学科博士学位授权点2个、一级学科硕士学位授权点2个、二级学科硕士学位授权点5个和1个博士后科研流动站。
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