梅花山自然保护区于1985年4月经福建省人民政府批准建立,1988年5月经国务院批准列为国家级森林和野生动物类型自然保护区,保护区地处福建西南部,是武夷山脉南段与博平岭之间的玳瑁山的主体部分,为上杭、连城、龙岩三县(市)交界地带,俗称“梅花十八洞”。
2021年2月5日,被中国林学会命名为第五批全国林草科普基地。2023年11月30日,国家林业和草原局公布《陆生野生动物重要栖息地名录(第一批)》,福建龙岩梅花山兽类及鸟类重要栖息地入选。
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