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上海市肿瘤研究所（Shanghai Cancer Institute）又名上海交通大学肿瘤研究所、上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所，成立于1958年，隶属于上海市卫计委。
肿瘤所主要研究方向为恶性肿瘤的流行病学与病因学，肿瘤发病机理及肿瘤细胞免疫治疗等生物高科技研究，探索肿瘤防治的新途径等相关领域。
截至2022年底，肿瘤所拥有三个园区，实验场地面积共26820平方米；设有17个PI研究团队和9个青年PI研究团队；有在编职工165人 。
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