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中国医药工业研究总院（简称“医工总院”）前身为1957年创建的上海医药工业研究院，隶属于中国医药集团有限公司，是经国务院学位委员会批准的全国首批具有博士、硕士学位授予权单位之一，是高层次、复合型药学人才的培育基地。
中国医药工业研究总院主要为创新药物及药品研发、制药工艺研究、药学领域研究生培养以及药品生产、销售，于1995年被批准设立（药学）博士后流动站，2000年被国务院学位委员会批准为药学一级学科博士、硕士学位授予单位。2012年，经教育部-中国工程院联合批准分别与复旦大学、上海交通大学开展联合培养博士研究生的试点工作，以培养基础研究与应用研究充分融合的复合型人才。2014年，与复旦大学进行联合培养硕士研究生的试点工作。经国务院学位委员会批准，2014年7月起上海医药工业研究院的药学一级学科博士学位授权点以及生物化工二级学科硕士学位授权点变更为中国医药工业研究总院。
根据2020年10月研究院官网显示，中国医药工业研究总院前后共有研究人员一百余名；下设5家研发机构、4家国家级中心、1个国家级重点实验室以及3家工业企业；下设有9个二级学科硕士点，7个二级学科博士点。
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